GIS-formaatteja ovat seuraavat 3D-Winin muunninfunktiot:
- GdalOgr - yleinen GDAL-kirjastoa käyttävä muunnin.
- Gml - yleinen GML-muotoa lukeva muunnin.
- Maagis - Maanmittauslaitoksen vanha formaatti.
- Mapinfo - MapInfo-ohjelman käyttämä formaatti.
- MtkGml - Maanmittauslaitoksen maastotietokannan GML-muoto.
- Shape - ESRI:n yleinen siirtotiedostomuoto.
- Xcity - Xcity siirtotiedosto, jota nykyinen Trimble Locus edelleen käyttää.
- Zetmap - Vanha HKR-päätteinen tiedostomuoto
Näille on yhteistä ominaisuustietojen käsittely GIS-ohjaintiedostoilla.